张海仓  副研究员  

研究方向:

所属部门:前瞻研究实验室

导师类别:硕导

联系方式:zhanghaicang@ict.ac.cn

个人网页:https://zhanghaicang.github.io

简       历:

张海仓,博士,曾任哥伦比亚大学博后科学家,字节跳动算法工程师。主要研究方向为生物信息(AI蛋白质设计和计算基因组学)和生成式AI模型。设计了预测基因变异致病性预测算法MVP、gMVP和DiffAffinity;开发了蛋白质设计算法CarbonDesign, CarbonNovo, AbX;开发了蛋白质结构预测算法CarbonFold。致力于建立生物大分子(蛋白质、DNA、RNA)结构预测和设计的统一生成模型。

主要论著:

1.Haicang Z, et al, Yufeng S. Predicting functional effect of missense variants using graph attention neural networks. Nature Machine Intelligence. 2022

2. S. Liu, T. Zhu, M. Ren, C. Yu, D. Bu, H. Zhang#. Predicting mutational effects on protein-protein binding via a side-chain diffusion probabilistic model. NeurIPS, 2023

3. M. Ren, C. Yu, D. Bu#, H. Zhang#. Accurate and robust protein sequence design with CarbonDesign. Nature Machine Intelligence. 2024

4. CarbonNovo: joint design of protein structure and sequence using a unified energy-based model. M. Ren, T. Zhu, H. Zhang#. ICML, 2024.

5. Antibody design using a score-based diffusion model guided by evolutionary, physical and geometric constraints. T. Zhu, M. Ren, H. Zhang#. ICML 2024 

科研项目:

获奖及荣誉: